2019
Guide for library design and bias correction for large-scale transcriptome studies using highly multiplexed RNAseq methods.
BMC Bioinform., 2019

2014
A promoter-level mammalian expression atlas.
, , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,
Nat., 2014

2013
SAMstrt: statistical test for differential expression in single-cell transcriptome with spike-in normalization.
Bioinform., 2013

2006
CAGE Basic/Analysis Databases: the CAGE resource for comprehensive promoter analysis.
Nucleic Acids Res., 2006

2004
Integrated analysis of the genome and the transcriptome by FANTOM.
Briefings Bioinform., 2004